巴氏杀菌机是根据对耐高温性强的结核菌热致死曲线和乳质中易受热影响的奶油分离性热破坏曲线的差异原理，在低温下长时间或高温下短时间进行加热处理的一种方法。其中，在60℃以下加热30分钟的方式，作为低温灭菌的标准，早为世界广泛采用。利用高温处理，虽对乳质多少有些影响，但可增强灭菌效果，这种方法称为高温灭菌，也就是在95℃以上加热20分钟。巴氏灭菌法除牛奶之外，也可应用于发酵产品，
巴氏杀菌法是针对牛奶的一种灭菌法，既可杀死对健康有害的病原菌又可使乳质尽量少发生变化。通常，市场上出售的袋装牛奶就是采用巴氏灭菌机生产的。工厂采来鲜牛奶，*行低温处理，然后用巴氏杀菌机进行灭菌，用这种方法生产的袋装牛奶通常可以保存较长时间。当然具体的处理过程和工艺要复杂的多，不过总体原则就是这样。
巴氏杀菌机配备有冷水循环系统，通常的制冷方式有两种，一种是压缩机制冷，这种制冷的方式速度快，效果好，还一种制冷方式是冷水循环制冷，主要是采用物理的降温方式，成本要低很多。
市场上巴氏杀菌机主要做商业用途，同时巴氏杀菌也是国际上的通用杀菌标准，在很多大型企业都在使用，市场上的纯牛奶其他口味的酸奶都是经过巴氏杀菌。随时绿色健康食品的发展，巴氏杀菌机在很多小型的奶牛场都是有使用的，小型奶牛场使用的都很是100升或者是200升的，主要是制作新鲜纯牛奶，向市场上配送。
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